Tutorial Registrasi Edu-PyMOL
Apa itu PyMOL?
PyMOL adalah perangkat lunak open-source yang digunakan untuk visualisasi dan analisis struktur molekul dalam format tiga dimensi (3D). Software ini banyak digunakan di bidang biokimia, bioinformatika, dan biologi struktural untuk memvisualisasikan protein, DNA, RNA, dan molekul lainnya yang diperoleh dari database seperti Protein Data Bank (PDB). Dengan PyMOL, mahasiswa dapat memahami struktur biomolekul secara lebih mendalam, membantu dalam studi interaksi molekul, serta mendukung penelitian dalam bidang docking molekuler dan desain obat.
Sebagai mahasiswa Biologi, khususnya dalam mata kuliah Biokimia, PyMOL dapat digunakan untuk:
- Memahami struktur dan fungsi protein dalam konteks biologi molekuler.
- Menganalisis ikatan kimia dan interaksi molekuler antara protein dan ligan.
- Memvisualisasikan mutasi genetik pada protein dan dampaknya terhadap fungsi molekul.
- Menyiapkan gambar berkualitas tinggi untuk publikasi atau presentasi ilmiah.
Bagi mahasiswa yang ingin menggunakan PyMOL untuk tujuan akademik, versi Educational-Use-Only tersedia secara gratis melalui registrasi di situs resmi. Berikut adalah langkah-langkah registrasinya.
Langkah-langkah Registrasi PyMOL Versi Educational-Use-Only
1. Buka Situs Registrasi PyMOL
- Kunjungi halaman resmi registrasi PyMOL Educational-Use-Only di tautan berikut:
👉 https://pymol.org/edu/
2. Pilih Opsi “Apply for Educational-Use-Only”
- Setelah halaman terbuka, cari tombol atau tautan bertuliskan “Apply for Educational-Use-Only”.
- Klik tombol tersebut untuk memulai proses registrasi.
3. Isi Formulir Registrasi
- Anda akan diminta untuk mengisi formulir dengan beberapa informasi, termasuk:
- Nama lengkap
- Alamat email akademik (email kampus)
- Institusi pendidikan (Nama Universitas)
- Departemen atau program studi
- Tingkat pendidikan (Undergraduate/S1)
💡 Catatan:
Gunakan email akademik kampus (contoh: @mhs.unesa.ac.id) untuk mempercepat verifikasi dan menghindari kemungkinan penolakan.
4. Kirim Formulir dan Tunggu Konfirmasi
- Setelah semua data diisi dengan benar, klik tombol “Submit” atau “Apply” untuk mengirim permohonan.
- Anda akan menerima email konfirmasi bahwa pendaftaran telah diterima.
💡 Catatan:
Proses verifikasi biasanya memakan waktu beberapa menit, namun bisa juga sampai beberapa hari kerja (weekdays). Pastikan untuk mengecek email secara berkala.
5. Menerima dan Mengunduh PyMOL
- Jika aplikasi Anda disetujui, Anda akan menerima email persetujuan berisi tautan untuk mengunduh versi PyMOL Educational-Use-Only.
- Ikuti tautan tersebut dan unduh installer yang sesuai dengan sistem operasi komputer Anda (Windows, macOS, atau Linux).
6. Instalasi PyMOL
- Setelah selesai mengunduh, buka file installer PyMOL.
- Ikuti langkah-langkah instalasi seperti yang tertera di layar.
- Setelah instalasi selesai, buka PyMOL dan masukkan lisensi atau kode aktivasi yang dikirimkan melalui email jika diminta.
7. Mulai Menggunakan PyMOL
- PyMOL kini siap digunakan untuk memvisualisasikan dan menganalisis struktur biomolekul.
- Anda dapat mencoba membuka file PDB (Protein Data Bank) untuk melihat struktur protein, menambahkan warna, serta melakukan berbagai analisis molekuler lainnya.
Sumber Gambar:
- By Schrödinger, LLC - PyMOL desktop app icon, GPL, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=67439289
Link untuk video:
- 01 - Tutorial untuk Registrasi For Educational-Use-Only PyMOL Builds dan License File-nya: https://youtu.be/UVgeZ1tJwdA
- 02 - Tutorial mengaktivasi For Educational-Use-Only PyMOL Builds: https://www.youtube.com/watch?v=FavO0idBUio
- 03 - Tutorial mengunduh Senyawa Kimia dari PubChem: https://www.youtube.com/watch?v=SerKKsx2Y_U. Video ini hanya menunjukkan tentang bagaimana cara untuk mengunduh senyawa kimia dari PubChem. Mengingat bahwasannya tugas rekan-rekan sekalian adalah mengunduh 1 senyawa monosakarida, 1 senyawa disakarida, dan 1 senyawa polisakarida, maka sila mengadaptasi langkah-langkah yang ditunjukkan di dalam video ini dengan nama senyawa mono/di/polisakarida yang rekan-rekan sekalian targetkan.
